In un incantevole vicolo lastricato della città vecchia è possibile vedere la sinagoga medievale meglio conservata di tutto il Portogallo. Costruita tra il 1430 e il 1460, fu utilizzata solo per qualche anno prima che l’editto del 1497, con cui Dom Manuel imponeva agli ebrei di convertirsi al cristianesimo o di lasciare il paese, costringesse la maggior parte di loro ad abbandonare il Portogallo. In seguito la sinagoga fu adibita a prigione, cappella, fienile e magazzino finché nel 1921 fu dichiarata monumento nazionale.

Grazie soprattutto all’impegno di Luís Vasco (sovente in città), il piccolo edificio è stato riportato all’aspetto che si ritiene avesse nel XV secolo. Il museo deve il proprio nome al matematico ebreo nonché astrologo reale che aiutò Vasco da Gama a pianificare i suoi viaggi. All’interno, tra le diverse lapidi su cui sono incise iscrizioni ebraiche del XIII e XIV secolo, si trova un blocco di pietra calcarea di colore rosa proveniente dalla Grande Sinagoga di Lisbona, risalente al 1307. L’ottima spiegazione della persona incaricata riporta in vita questo luogo e la sua storia.