Il convento gotico fu fondato nel 1330 dalla pia Dona Isabel, moglie di Dom Dinis, che qui fu sepolta; la successiva alluvione rese però necessario lo spostamento della tomba che oggi si trova nel più alto Convento de Santa Clara-a-Nova. Nel museo adiacente al convento sono esposti i reperti archeologici rinvenuti durante gli scavi e si può assistere a due proiezioni, una riguardante la vita delle suore che abitavano il convento, mentre l’altra è una documentazione dei lavori di restauro, durati ininterrottamente una ventina d’anni, resi necessari dall’alluvione del XVII secolo.