Di fronte alla chiesa, nella piazza, si trova questo museo gestito dall’università e inaspettatamente ricco di informazioni per un piccolo centro abitato come Yanque, che illustra coscienziosamente e dettagliatamente la cultura del Cañon del Colca. Meritano un cenno, in particolare, i tabelloni sui tessuti inca, le deformazioni craniche, l’agricoltura locale, l’architettura religiosa e un breve resoconto su Juanita, la "fanciulla dei ghiacci".