Circa 2 km a nord della città sorge la Missione Cattolica dello Spirito Santo, raggiungibile percorrendo un lungo viale ombreggiato da alberi di mango. Al suo interno è allestito l’interessantissimo Catholic Museum, una delle attrattive più importanti di Bagamoyo nonché tappa imperdibile della visita alla città. Nello stesso complesso di edifici si trova la cappella dove fu sepolto il corpo di Livingstone prima di essere trasportato a Zanzibar Town durante il suo viaggio di ritorno in patria verso l’Abbazia di Westminster. La missione risale al 1868, anno della fondazione del Freedom Village, ed è la più antica esistente in Tanzania.