Questo museo illustra le vicende storiche di Arequipa e di tutto il Perú in modo esaustivo, anche se non particolarmente emozionante. È suddiviso in sale dedicate a varie epoche, dai reperti preispanici all’indipendenza e dall’era repubblicana alla Guerra del Pacifico. Dopo aver contato gli eroi che hanno sacrificato la loro vita alla nazione (e ce ne sono parecchi), visitate l’adiacente Museo Arqueológico Chiribaya (compreso nel biglietto d’ingresso), che ospita una straordinaria collezione di manufatti della civiltà preincaica chiribaya, fra cui tessuti ben conservati e l’unica collezione di ori preincaici del Perú meridionale.