La più venerata delle chiese di Cebu ospita una statua fiamminga di Gesù bambino (Santo Niño) che risale ai tempi di Magellano ed è oggetto di grande devozione. La chiesa è sopravvissuta a molte vicissitudini: fondata nel 1565 (è la prima chiesa delle Filippine), fu distrutta da incendi per ben tre volte prima che venisse eretta l’attuale struttura barocca, nel 1737. La facciata e il campanile subirono gravi danni a causa del terremoto del 2013, ma sono stati restaurati.