L'esplorazione delle grotte, sia sulla terraferma sia sui fondali marini, è spettacolare e facilmente praticabile. Sull'isola di Tongatapu è presente una grotta, su quella di Vava'u ve ne sono numerose, mentre l'isola di 'Eua serba al visitatore dozzine di grotte calcaree. L'esplorazione delle grotte sottomarine è consigliabile sull'isola di Ha'apai, che presenta una grotta molto profonda, popolata da moltissimi pesci elettrici o fosforescenti. Grazie alle gradevoli temperature delle loro acque, che oscillano sempre tra i 23° C e i 30° C, le attività di snorkelling, surf, nuoto e diving sono perfette in qualsiasi dei principali arcipelaghi di Tonga. Vulcani, relitti, canyon, barriere coralline, una sorprendente varietà di pesci di scogliera e una visibilità che in alcuni punti arriva fino a 70 m di profondità rendono le immersioni e lo snorkelling a dir poco spettacolari. Il surf, che qui è possibile praticare in ogni periodo dell'anno, non ha eguali in nessun'altra parte del mondo. Il surf migliore si pratica alle isole Ha'apai e Vava'u, mentre a Tongatapu il luogo migliore è Ha'atafu Beach.

La navigazione con il kayak è uno sport in forte diffusione sulle isole, e Tonga è in grado di offrire un vasto ambiente per praticare questa attività impegnativa in mare. L'arcipelago di Vava'u presenta acque chiare, calme e riparate, mentre l'arcipelago di Ha'apai dispone di un mare un po' più aperto. La stagione migliore per il whalewatching (osservazione delle balene) va da giugno a novembre sulle isole di Tongatapu e di Ha'apai, e da luglio a novembre su quella di Vava'u. Durante le escursioni in barca per l'osservazione delle balene, microfoni subacquei cattureranno i canti dei cetacei per farli ascoltare ai visitatori. Le flotte charter disponibili per la pesca d'altura si stanno diffondendo su tutto l'arcipelago di Tonga, ma è possibile anche dedicarsi alla pesca meno competitiva, con un buon libro, una spiaggia deserta e una lunga canna da pesca.