Racchiuso tra il Brasile, l'Argentina e la Bolivia, il Paraguay è privo di sbocchi sul mare. Il Río Paraguay, il terzo fiume in ordine di lunghezza dell'emisfero occidentale, divide il paese in due parti disuguali. Nella zona a ovest del fiume si estende il Chaco, una regione sterile e scarsamente popolata che costituisce circa il 60% del paese; la sezione orientale, dove è concentrata la stragrande maggioranza della popolazione, è invece costituita da un altopiano con praterie interrotte da tratti di foreste subtropicali che si spinge fino al Río Paraná, al confine con il Brasile e l'Argentina.

Il Paraguay possiede una fauna piuttosto varia che comprende pappagalli e parrocchetti, micterie, are color giacinto, pecari del Chaco, in passato ritenuti estinti, grandi rettili quali caimani, anaconda e boa constrictor. A causa dell'alta densità di popolazione, nelle zone rurali del Paraguay orientale mammiferi quali il formichiere gigante, il lupo dalla criniera, il tapiro brasiliano e il giaguaro stanno rapidamente scomparendo.

Il Paraguay orientale ha un clima umido e precipitazioni distribuite uniformemente per tutto il corso dell'anno. In estate (da gennaio a marzo) le temperature sono elevate pressoché ovunque (in media 35°C) mentre in inverno (da luglio a settembre) possono scendere a 5°C. In questo periodo talvolta si verificano delle gelate, ma la neve è praticamente assente. Nel Chaco fa più caldo e le precipitazioni cadono in modo più irregolare.