Air Tanzania gestisce sei voli settimanali tra Zanzibar e Dar es Salaam in Tanzania, mentre ZanAir e Coastal Aviation hanno voli giornalieri tra Der es Salaam, Zanzibar e Pemba. Ci sono collegamenti internazionali diretti da Zanzibar con Oman Air (via Muscat), con Ethiopian Airlines (via Addis Abeba) e Kenya Airways (via Nairobi). Se potete permettervelo, prendete in considerazione l’ipotesi di arrivare sull’Isola di Zanzibar in aereo per evitare i procacciatori di clienti al porto dei traghetti. L’aeroporto di Zanzibar si trova 7 km a sud-est di Zanzibar città. C’è una linea di autobus che collega la città con l’aeroporto, oppure poterete prendere un taxi. Numerosi sono gli alberghi di Stone Town che offrono il trasporto gratuito da e per l’aeroporto. Su tutti i voli che decollano da Zanzibar viene applicata una tassa di imbarco di US$20. Ci sono dei traghetti giornalieri che collegano Dar es Salaam e Zanzibar e tre traghetti settimanali sono in partenza (via Zanzibar) dalla terraferma per Pemba; ci sono anche alcuni traghetti settimanali che collegano Zanzibar e Pemba. Le tariffe dei traghetti includono la tassa portuale di E500.00.

All’interno dell’arcipelago non ci sono collegamenti aerei. Il collegamento tra le maggiori città dell’Isola di Zanzibar è assicurato da alcuni camioncini convertiti o dai dalla-dalla (minibus), ed è facile inoltre noleggiare auto, motorini o motociclette. In genere i prezzi sono ragionevoli e ci sono poche scocciature, anche se i guasti meccanici sono abbastanza comuni, così come gli incidenti. Considerando le ridotte dimensioni dell’isola, spesso è più facile, e non poi così dispendioso, semplicemente pattuire una cifra con il tassista di turno. Potrete anche noleggiare una bicicletta, se vi sentite in forma, oppure organizzare delle escursioni nei dintorni dell’isola tramite un operatore turistico