Con una forma che ricorda vagamente il corno afgano rovesciato, il Mozambico si estende per 2500 km lungo la costa sud-orientale dell'Africa, confinando a nord con la Tanzania, a nord-ovest con Malawi e Zambia e a sud-ovest con il Sudafrica e lo Swaziland. L'isola di Madagascar si trova direttamente a est, 400 km attraverso il Canale di Mozambico.

La pianura costiera, che si estende a sud per 200 km, si modifica in montagne e altipiani a nord e ad ovest. Due dei più lunghi fiumi dell'Africa meridionale, lo Zambesi e il Limpopo, attraversano il paese. Gli altri principali corsi d'acqua sono il Save e il Rovuma, che costituiscono il confine settentrionale con la Tanzania. L'imponente lago Malawi (anche chiamato lago Nyasa) forma parte del confine con il Malawi.

Procedendo verso occidente il paesaggio cambia bruscamente: da una stretta striscia di spiaggia ornata di palme si passa a un'ampia fascia di savana e boschi e quindi ai monti coperti di foreste. Fra gli alberi si trovano legni duri, acacie e papaie, mentre la fauna include il rinoceronte nero, raro e in via d'estinzione.

In Mozambico ci sono numerose variazioni regionali, ma in linea di massima la stagione secca va da aprile a settembre, quando la temperatura media giornaliera tocca punte di 27°C, mentre la stagione delle piogge perdura per gran parte del resto dell'anno, quando la temperatura massima media giornaliera tocca i 31°C.